Zawartość czasopisma Zoophilologica. Polish Journal of Animal Studies, oprócz własnego archiwum na stronie internetowej https://journals.us.edu.pl/index.php/ZOOPHILOLOGICA/index, jest archiwizowana w następujących bazach danych: AskBisht.com Journal Directory, BazHum, CEEOL, CEJSH, DOAJ, EBSCO, ERIH Plus, IC Journal Master LIST, POL-index, Polskiej Bibliotece Narodowej, SCOPUS.